E. coli gây bệnh ngoài đường ruột (ExPEC) đa kháng thuốc mới nổi là một trong những nguyên nhân hàng đầu gây ra các bệnh nhiễm trùng máu ở Việt Nam và nhiều nước Châu Á. Nguồn lây nhiễm trong tự nhiên, yếu tố nguy cơ của kí chủ và phương thức lây truyền của các dòng ExPEC hiện nay chưa được nghiên cứu kỹ lưỡng.

Trong nghiên cứu này, chúng tôi áp dụng phương pháp CH-typing để tầm soát nhanh chóng các chủng ExPEC quan trọng liên quan đến nhiễm trùng ở người cũng như sự khu trú của nó ở người lành và động vật khỏe mạnh. Các chủng chiếm ưu thế được giải trình tự toàn bộ bộ gen, và dữ liệu này được liên kết với các thông tin dịch tễ học liên quan nhằm nghiên cứu cách thức lây nhiễm, sự phát triển đề kháng kháng sinh và các yếu tố nguy cơ liên quan đến nhiễm trùng đường máu do ExPEC gây ra.