Công việc của ông trải dài từ y sinh học đến chính sách y tế toàn cầu, với chủ đề thống nhất về quy định và khả năng phục hồi của các hệ thống phức tạp ở cấp độ sinh học, hành vi và lập trình.

Tiến sĩ Shankar có nhiều kinh nghiệm với tư cách là chủ nhiệm đề tài của các thử nghiệm ở các nước có thu nhập thấp và trung bình đánh giá tác động của dinh dưỡng và các biện pháp can thiệp khác đối với tỷ lệ tử vong và bệnh tật của bà mẹ, trẻ sơ sinh và trẻ em, đối với sự phát triển nhận thức của trẻ, bệnh sốt rét, tiêu chảy và viêm phổi cũng như chức năng miễn dịch .

Nghiên cứu của ông vào năm 2020 bao gồm thiết kế chẩn đoán huyết thanh học và phân tử được hỗ trợ kỹ thuật số đối với nhiễm SARS-CoV-2, đánh giá COVID-19 đối với thai kỳ và tác động của những thay đổi hệ thống y tế liên quan đến COVID-19 đối với sức khỏe bà mẹ và trẻ sơ sinh ở Indonesia.