Dự án Tiến sĩ của Phương tập trung nghiên cứu vai trò của vi khuẩn cộng sinh và phơi nhiễm kháng sinh trong sự xuất hiện của vi khuẩn và mầm bệnh đa kháng thuốc. Vi khuẩn cộng sinh ở người được coi là nguồn dự trữ chính của các yếu tố quyết định di truyền kháng kháng sinh (AMR), có thể được chuyển giao theo chiều ngang sang mầm bệnh vi khuẩn, tạo ra các dòng vô tính kháng thuốc mới và nguy hiểm. Các nghiên cứu trước đây đã chỉ ra rằng sự trao đổi gen/plasmid AMR giữa vi khuẩn cộng sinh ở người và mầm bệnh đường ruột có thể được tăng cường hơn nữa khi có kháng sinh. Tuy nhiên, có rất ít thông tin về các yếu tố thúc đẩy quá trình này.

Thông qua nghiên cứu này, cô hy vọng sẽ giúp làm sáng tỏ việc sử dụng kháng sinh ở mức độ cao tạo điều kiện cho sự lan rộng của tình trạng kháng kháng sinh như thế nào, và nhờ đó cung cấp thông tin quan trọng cho các nhà hoạch định chính sách y tế công cộng địa phương trong việc thiết kế các quy định về kháng sinh phù hợp. Với sự hiểu biết tốt hơn về cơ chế phân tử của quá trình chuyển gen ngang, cô sẽ tiếp tục nghiên cứu các chiến lược trị liệu khác nhau để ngăn chặn quá trình này.